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重庆市生殖与遗传研究所是1995年由重庆市机构编制委员会通过了重卫人[1994]66号文件《关于重庆市妇幼保健院增挂重庆市遗传与生殖研究所牌子的请示》，同意重庆市妇幼保健院增挂重庆市生殖与遗传研究所牌子，实行三块牌子(重庆市妇幼保健院、重庆市妇产科医院、重庆市生殖与遗传研究所)、一套班子的体制,其机构规格、人员编制不变,由其前身重庆市妇幼保健院优生室发展而来。2001年9月通过国家卫生部人类辅助生殖技术开展资格验证，成为首批获国家卫生部批准的人类辅助生殖中心之一。
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